申请新版企业三方协议税务，首先应该了解三方协议税务的具体要求，如双方基本资料、申请条件及材料；其次应当根据企业需求制定不同的税务协议原则；最后将企业的相关信息和所需材料提交税务部门进行审核并发放税务凭证。拓展知识：企业实施三方协议税务利于税务合理化，有助于企业降低税收缴纳，推动科学会计制度的建立及实施，改善企业财务管理水平。应用案例：全国各地企业实施税务协议，比如，宁夏回族自治区的海拉尔矿业有限公司实施了框架性的三方税务协议，有效降低了企业每年的税负，并助力其发展壮大。