客户丢失普通发票的处理方法主要有以下几种： 一、可以申请补发普通发票： 1、申请补发普通发票时，应首先与客户确认所购货物的价格，确认购货时间，并确认是否应退货。 2、向税务机关申请补发普通发票，并根据实际情况签署“补发普通发票申请表”。 3、签署完“补发普通发票申请表”后，使用营业发票系统，申请补开发票以及印制发票。 二、申请临时发票： 1、先确认客户的购物价格，购物时间以及是否应该退货； 2、向税务机关申请临时发票，并根据实际情况签署“临时发票申请表”； 3、签署完“临时发票申请表”后，使用营业发票系统，申请补开发票以及印制发票。 应用案例： 假设XYZ公司针对一位客户有一定的合同或协议交易，但是在运输过程中发票丢失，那么XYZ公司应该先与客户确认交易价格，购物时间以及是否应该退货，然后向税务机关申请补发普通发票或临时发票，并根据实际情况签署相应的申请表，最后使用营业发票系统，申请补开发票以及印制发票。