农业公司记耕田费用的方法是：将耕田费用分为材料和劳务两项，然后记录到应付账款科目中。具体而言，购买水渠管道等材料时，可以在购入凭证中填写科目“应付账款-原材料”，金额为当前所购材料的价格；有关劳务方面的费用，可以在购入凭证中填写科目“应付账款-劳务费”，金额为当前劳务费用的价格。 比如，某农业公司购买水渠管道，总价为1000元，按照上述的记账方式，购入凭证中填写科目“应付账款-原材料”，金额为1000元，填写对方即为供应商；如果此次购买还有相应的劳务费用的话，那么可以在购入凭证中填写科目“应付账款-劳务费”，金额为相应劳务费用的价格，填写对方即为劳务提供方。