嗯，根据中国税法，当小规模纳税人与一般纳税人发生交易时，小规模纳税人应当承担3%的增值税，一般纳税人则需承担9%的增值税。出于便利，双方可以就增值税的税额达成协议，例如小规模纳税人只缴纳3%，其余6%由一般纳税人补缴。关于您问的城建税、教育费附加、地方教育附加税缴纳问题，双方可以根据实际情况进行协商，如果双方确定小规模纳税人要补缴6%的税款，那么6%的税款也包括了城建税、教育费附加、地方教育附加等税款，因此，双方在协商过程中也要考虑相应的税款分配问题。