跨市开票可以说是有一定的税务风险的，特别是对于个人而言，企业也可能会受到政府的影响。由于税收的法律法规变动较快，不同的地区的税务管理制度可能存在差异，注册地为东莞，开票机器在深圳开，如果开票人和发票终端之间发生跨省开票，可能会违反当地的税收管理规定，可能会受到查处。此外，纳税人还需要注意票据填写的准确性，不能随意更改发票，准确填写收款人信息，以免发生“黑票”等问题，防止税务风险。因此，开票人应该时刻关注国家有关税收政策，正确使用发票，加强自身税务管理，避免造成不必要的风险和损失。