可以，但是需要经过一定的流程和手续：首先，总公司应根据子公司的申请将资金转入子公司的财务账户中；其次，总公司应根据子公司开具的发票编制和审核资金支付凭证，并出具正式发票给子公司；最后，在你付款完成之前，子公司需要向税务部门申报及缴纳相关税款。拓展知识：发票开给子公司就是按照委托代理发票开出，即由总公司经营过程中产生的收入自行结算发票，发票由总公司开出，但税款由子公司自行缴纳。