销售农用化肥开普票税率是3%。即，发票金额乘以3%，即为增值税和消费税。例如，一箱甲醇农药，发票金额为500元，增值税和消费税即为500×3%=15元。另外，还有其他农资，如发动机油、种子苗籽等，其中发票金额冲0-30元，增值税和消费税为5.5%；发票金额大于30元，增值税和消费税为3%。此外，发票上面还可以加印“免税”等注释，来降低税收负担。