分公司员工的社保是由总公司代缴的，每个月分公司将代缴纳的钱转给总公司，对于分公司来说，从账务上分公司应该区分出自己缴纳员工社保所需要的费用，并建立账户记录。在报税时，分公司需要把份公司缴纳的社保费记录在个人社保部分里，以便于税务机关核算查询。 如果分公司社保费用过大，分公司可以考虑与总公司签订劳动合同，这样可以有效减少分公司的社保费用。此外，分公司还可以根据地方政府政策，签订一定的人力资源服务协议，将员工社保费用由分公司承担转移到总公司承担，以此降低财务负担。