在增值税申报表中，专票金额和普票金额超过四十五万的，普票金额只有十六万的情况下，普票金额应该填写在第5栏。因为根据《增值税暂行条例》，当专票和普票金额合计超过四十五万时，普票要按超过部分合计金额填写第5栏，专票填写剩余部分金额第18栏，以及对应的税率和税额。 拓展知识：增值税申报表中，第5栏是“免税收入”，第18栏是“应税收入”，第19栏是“增值税”，也就是说，免税的普票金额填写在第5栏，应税的专票金额填写在第18栏，税率及税额则填写在第19栏。