购买软件系统的一般折旧凭证如下：计入预付账款25万元、借计提折旧费25万元，明细按照购进无形资产或者长期待摊费用科目借贷计入。折旧方法可以采用平均年限法或者尺度法，根据具体情况来确定折旧年限。 另外，在付款的时候，由于有预付账款的项目，所以记录应付账款的时候也可以在贷方记录预付账款的金额，借方记录相应的科目，如购进软件的科目，把费用和折旧费一同记录。