股东转进来垫付材料款的账务处理流程可以分为以下几步： 1. 确认股东转进来的垫付材料款的金额和交易来源； 2. 将股东转进来的款项入账，按正确的会计科目做相应的分录记账； 3. 确认垫付材料款的项目及相应的成本； 4. 根据具体情况，结合公司内部制度，确定垫付材料款的支付方式，做相应的支付凭证； 5. 检查垫付材料的发票是否正确； 6. 将垫付材料款的发票和相应的入账凭证报送给财务部门做结算处理。