子公司和总公司之间款项可通过电汇、现金、支票、支付宝、微信支付等多种方式转账，由于现代金融业的发展，大部分公司会倾向于使用电子支付系统，电汇和支票也很常见，而在一些特殊情况下，现金支付也是一种常见的支付方式。电汇一般是通过银行转账的方式，电汇也有几种不同的形式，比如国际电汇或者国内电汇，支票也是常见的款项转移方式。目前，科技的发展使得支付宝、微信支付等移动支付方式也成为了一种通用的支付方式，它们具有快捷、便捷、安全等优势。在选择支付方式时，公司需要根据实际情况选择最合适的支付方式，节约成本、提高工作效率。