自产自销的农产品减免增值税需要备案，当申请减免增值税时，企业需要先向税务机关提出申请。税务机关会处理申请，审核批准后，把减免备案号和具体减免品种发给申请人，然后以减免备案号为依据，按减免货物进行结算。 收入做凭证的时候，企业需要根据具体情况，向税务机关报送销项税款，特殊纳税人的则是直接征收的方式，不用报送销项税款。 拓展知识： 增值税的减免政策，有时是政府为支持、解决某些行业或者企业的财税困境而采取的一种政策，给企业创造更大的经济效益，同时也更好地提高政府收入和企业效益。