网银查询承兑余额的方式有：一、使用网银客户端进入个人网上银行，选择“票据管理”，然后点击“查询承兑余额”，可以查看当前有效的承兑余额。二、使用营业厅客户端进入工商银行网上营业厅，选择“票据管理”，然后点击“查询承兑余额”，可以查看当前有效的承兑余额。有可能因为票据可能被背书多次，持票人交易次数多，导致历史上有过结清状态，但是最终没有到支付机构结清，任然会显示在持票人中，建议查询相应的证件号码，查看票据的当前状态，确认是否结清。