零售连锁药店总店在市里，分店有在市里的，也有在县城的，也有在乡镇的，增值税所得税应当分别按照各个店铺的纳税地址申报，也就是说各个店铺分别在当地税务机关申报，办理手续按照各个税务机关的规定进行。在缴纳增值税的时候，企业应当了解最新的增值税征管政策，同时要注意备份相应的税务凭证，以便应付税务机关的稽查。此外，拓展知识：增值税所得税是将增值税转化为企业所得税，需要企业承担更高的税务责任，其中一项是税务上的报表备案等审核，全面限制企业税务行为，及时完善，加强执行力度，以便税务机关及时掌握企业纳税行为。