根据《企业所得税法》的规定，在企业的内部分公司间存在独立核算的情况下，总公司在汇算清缴或者季度申报所得税时需要做合并申报。即，总公司在申报所得税时，应当把全体企业收入、利润及税费等信息，通过汇总考虑后，代表全体企业做一次综合申报所得税。合并纳税并不是必须的，当各个分支机构有完全独立的业务，即没有任何物质上的联系，则可以分别缴纳税款。 拓展知识：企业申报所得税时，应注意对分支机构对以下几项情况进行归并申报：营业收入、销售成本、营业税金及附加费、营业利润、企业所得税、年度应纳税所得额、减除费用及扣除项目、应纳税所得额明细、免税所得、减免税额、实际纳税额等情况。