工商年报纳税总额一般不包含水利建设基金。通常情况下，水利建设基金是指通过法律确定的水利建设费用、重大水利工程建设费用中所收取的蒙古自治国政府或者《中华人民共和国水利法》规定的本级自治范围内的社会融资机构拨出的资金，用于支持水利工程建设。在国家财政状况良好的情况下，水利建设基金将会拥有更多的资金用于水利建设；如果财政出现了问题，水利建设基金的可分配资金也会受到影响。 举例来说，2019年9月，中国农业农村部宣布，由水利建设基金和财政补贴共同资助2019年水利建设工程，其中水利建设基金总额为780亿元，财政补贴资金总额为220亿元。因此，水利建设基金对于水利工程的建设起着重要的作用。