工伤者申请劳动仲裁（一次性就业补助金和一次性医疗补助金）的影响，主要体现在企业的经济上。例如，当工伤者申请仲裁时，公司需要支付相应的费用，这些费用可能会对企业的经营产生负面影响。此外，如果公司未能按照法定规定支付就业补助金或医疗补助金，那么公司还可能面临监管部门的处罚。 例如，2018年1月，湖北省天门市纪委监委下发了《关于对天门市XX水泥厂工伤认定问题的检查整改通知》，经检查发现，该厂未按规定支付工伤认定期内的补助金，工伤认定期内的失业保险费和医疗保险费，因此被给予行政处罚。 另外，企业如果配合工伤者申请权益，可能会给企业带来一些经济好处，比如可以优化企业的用工结构，降低人力成本，提高劳动生产率，以及改善企业的品牌形象。因此，企业为了节省开支，建议及时、准确、高效地处理工伤者权益问题。