个人所得税汇算清缴单位集中汇算是在税务机关网络系统上操作的。一般情况下，企业、机关事业单位等交税主体会在自己的税务机关网络系统上，填写税务系统提供的汇算清缴申报表，并按照税务机关的要求，把所得税汇算清缴款汇入指定的银行账户，完成汇算清缴。拓展知识：在汇算清缴过程中，企业或者机关事业单位应当准确、及时地填写纳税申报表，并按照有关税收征收管理办法，准确确定应纳税所得额、应纳税额等。