首先，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》，个人所得税返还手续费应当缴纳增值税。因此，当发现公司没有申报增值税时，应马上补缴增值税。 其次，补缴增值税的方法有以下几种： 1. 前置审批制度：通过纳税机关的跨区域审批，提交补缴增值税申请材料，由税务机关审核后发放缴纳增值税的审批文件。 2. 发票式补缴：按照实际发生的费用，在税务机关注册的发票代开机构开具增值税发票，由纳税人在税务机关注册的增值税缴款机构缴纳增值税。 最后，补缴增值税还应注意以下问题： 1. 补缴增值税时，纳税方补缴增值税期限和补缴增值税办理流程。 2. 必须准确填写补缴增值税申报表，并准备相应的补缴材料，以防止税收稽查的情况发生。 拓展知识：补缴增值税时，可以采取宽限期方式补缴，这样可以减轻企业缴纳增值税的负担。