您好！关于您的问题，由公司负担的个人所得税应计入公司的会计科目为“应交税费”。这里需要注意的是，如果公司支付的个人所得税或者直接纳入个人薪资中，则应将这部分“个税”金额归到“工资福利支出”科目中，而不是“应交税费”科目。拓展知识：在管理会计中，对由公司负担的个人所得税，会计要考虑其是否会影响公司的成本计算，也需要考虑其对现金流量的影响等因素，以便在管理决策中更有效的利用这部分税收费用。