根据相关税务法规，若小规模纳税人收了50多万的专票，意味着公司在税收上的风险可能较大。为确保税务合规，建议公司重点关注专票交易的税收凭证（如发票、收付款单据等），及时将交易信息录入账务系统，避免因个人因素造成的税收违法行为。同时，为确保账务数据的准确性，建议公司可以利用合适的财务软件辅助处理专票交易，以防止账务数据出现错误。