跨区预缴增值税除了本地纳税人要按照本地法律法规缴纳本地增值税外，还要按照《中华人民共和国跨区域经营预缴增值税管理暂行条例》实施外区跨区域经营预缴增值税实施增值税。跨区预缴增值税主要由本地纳税人向县（市、区）地方税务机关申报和缴纳，由地方税务机关协调本地税、外地税等，把外地税款及时转给外地税务机关，以保证本地纳税人遵守本地法律法规、正确完税的要求。