处理未扣款的印花税申报，首先应当在税务部门获取更多的信息，以确定印花税申报未扣款的原因。一般的原因有：纳税义务人未及时填写申报表；开户行未及时对申报表进行确认等。如果是由于纳税义务人本人引起的，需要补充相关资料，并结清欠税。如果是开户行引起的，需要补充缴税支付凭证，并提供缴税申报表。有关印花税申报未扣款的处理，应根据具体情况，严格按照有关规定办理。 拓展知识：印花税是中国实施的一种消费税，它一般用于证券、保险、期货、票据、有价证券等交易的交易手续费和佣金，主要出台的目的是为了确保市场有序发展和社会稳定。