是的，公务交通费个人所得税需要代扣。如果是中国缴纳税款的居民，按照规定，报销的公务交通费就是个人所得税的应纳税所得额，需要按照税法的规定进行计算和缴纳税款。主管税务机关依据税法规定，责令缴纳欠缴的税款，并处以滞纳金。此外，个人有可能被追缴滞纳金，一旦拖欠税款超过国家规定的追缴期限，就需要承担严重的法律责任，甚至可能会被追究刑事责任。