从实践角度来看，运输发票的备注栏上不填起始地，会影响发票的合法性；因此，从法律角度来说，运输发票备注栏上不填起始地也是不合格的。在《中华人民共和国发票管理条例》中规定，发票应当按照规定的格式、内容和字体印制，其中必需包括发票起始地，这就强调了发票备注栏上必须填上起始地。此外，中国国家税务总局在《关于完善运输发票管理有关问题的通知》中也明确规定：发票备注栏上必须填写起始地。因此，发票备注栏上不填起始地是不合格的。