企业实际发生的业务费处理有多种方式，具体应根据企业业务情况和实际情况考虑。通常可以采用以下方式来处理： 1、现金处理：企业可以将实际发生的业务费直接用现金结算； 2、转账处理：企业可以将实际发生的业务费用通过银行或其他金融机构进行转账； 3、代收代付处理：企业可以将实际发生的业务费用委托给第三方机构进行收取与支付； 4、其他处理方式：企业还可以通过信用卡等其他支付方式来处理实际发生的业务费用。 此外，现在电子商务正在不断发展，企业也可以尝试网上支付方式，采用支付宝、微信支付等处理实际发生的业务费用，这样有利于提高企业支付效率。