小规模纳税人增值税季报申报流程分为三步。首先，纳税人要按照季度末日把缴纳税款的凭证审核清楚，把开票发票上传到税务机关指定的网站上；其次，纳税人要按照季度税收管理制度，就本季度缴纳的增值税填写季报表，上传到税务机关的网站；最后，纳税人还要按照税收管理制度，根据本季度增值税缴纳情况，逐一把季报表打印出来下载，将经审核的季报表单、开票发票等资料交存税务机关办理申报手续。 案例： 某公司是一家小规模纳税人，为了按时把当期增值税缴纳到位，缴纳当期增值税后，按照季度税收管理制度，就本季度缴纳的增值税填写季报表，上传到税务机关的网站；另外还要把开票发票上传到税务机关指定的网站上；最后还要把季报表打印出来，并把经审核的季报表单、开票发票等资料交存税务机关办理申报手续。只有按照上述流程办理，公司才能完成对季报申报手续的申报。