答复：是的，公司可以将房租依据部门划分使用，同时也可以部分作为研发费用投入。拓展知识：例如，一个研究机构可以将其办公空间扩展到包括办公室，会议室和实验室等，可以根据部门的不同需求分别来确定相应的房租预算，并将其中的一部分用于研发费用。另外，在进行办公室租赁时，也可以考虑未来研发扩大开支，采取长期租赁的方式，确保研发费用的投入。