是的。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十三条规定，纳税人应当在同一税收管理地的使用的货物取得进项税额时，按照以下规定扣减预缴税额：（一）异地购进的货物应当减去在异地预缴税款；（二）本地购进的货物应当减去在本地预缴税款；（三）异地与本地购进的货物应当减去异地和本地预缴税款。由此可见，当纳税人在本地电子申报增值税的情况下，应当减去在异地预缴的税款，以减少税收负担。