公司代扣个人所得税应当计入“借应交税费-个人所得税”与“贷银行存款”，这是一笔往来账户的管理，属于短期资金运作。在做分录时，借方为“其他应收款-某人”，贷方为“代应交税费-个人所得税”。这样就能将支出的个人所得税科目记入税务科目体系中。 拓展知识：在企业支付个人所得税时，企业应当在纳税申报时，预扣预缴个人所得税，并将款项代扣代缴给财务科，以便财务科完成应交税收计缴。根据《中华人民共和国企业所得税法》第十五条，企业应当向税务机关报送企业所得税纳税申报表和相关凭证。