当企业季度开票金额超限时，应立即申请有关部门复核和核准。申请包括：一、提出开票申请书：申请人向开票有关管理部门提交开票申请书，内容应包括季度开票金额已超过限额的原因，已采取的补救措施等;二、提交季度开票的销售额及税额明细表和本季度发票开具明细表：应按有关要求提交季度开票的销售额及税额明细表和本季度发票开具明细表，以准确确定季度开票金额;三、提出补救措施：申请人应提出及时和有效的补救措施，以促使超限开票金额能够得到有效控制，并提供改善性措施，防止未来超限开票；四、提出其他相关证明文件：经营者根据实际情况提供其他有关证明文件，以说明季度开票金额的情况。只有提出完善的申请材料，才能促使有关部门及时复核和核准，以减轻企业超限开票的不利影响。