是的，缴纳第三季度水资源税的计税依据是7月、8月和9月份的实际取水量。根据《水资源税暂行条例》的规定，在收缴水资源税的过程中，税收机关应当以上一季度的查实取水量作为计税依据。因此，纳税人在缴纳第三季度水资源税时，应当提供7月、8月和9月实际取水量，以便税收机关准确计算税额。 此外，为了合理和公正收缴水资源税，税收机关还可能根据要求企业附加缴纳水资源税，即在上一季度所征收的税额基础上，根据企业所涉及的生态保护措施，进一步收取适当的附加税率。此外，税收机关还可能根据企业履行社会责任的情况，减免部分水资源税。