进项发票已经抵扣又红冲的做账方法是：将红字发票上的增值税销售额等金额，反映在月末结账时的应交税额中。具体的做法如下： （1）原发票金额的计算：首先，要按照红字发票所标明的原发票金额进行计算，包括增值税销售额，税额，以及其他金额； （2）红冲金额的计算：其次，要按照红字发票所标明的红冲金额进行计算，也包括增值税销售额、税额和其他金额； （3）月末的会计处理：最后，将上述计算出的原发票金额和红冲金额进行累加，作为计算月末应交税额的依据。 例如，一张进项发票金额为1000元，红冲后金额为500元，其中增值税销售额为500元，税额为50元。在月末结账时，增值税销售额应为1000元，税额应为100元。