可以，您公司发票抬头可以用来做账，但要视具体情况而定。另外，招标代理费的开票是按照国家的相关政策来实施的，比如如果抬头发票在《收费管理条例》和《发票管理办法》中未有明确规定的收费，是不能开具发票的。因此，如果发票的抬头是由招标代理机构按规定开具，那么您公司可以记账，并可以于政府税务部门做财务报表报税。拓展：甲方招标代理费发票，注意费用是否符合《收费管理条例》和《发票管理办法》的规定，以避免税务问题。