环境保护税的申报主要包括以下几个方面： 1、税务机关审查税务登记信息：主要是录入纳税人信息及税种登记情况，准备提交税务申报表。 2、税务机关核查环境保护税收缴款，包括查验实际发生的税收收入、检查税务登记的税种和税率情况、以及税收征收等方面的情况。 3、在环境保护税收缴款上填写税务总表：包括填写税种和税率，填写收入总额等信息。 4、税务机关核实税务缴款：查验税务登记的税种和税率，检查实际发生的税收收入，确定支付主体及所属税务管理机关，按规定填写税务总表。 5、税务机关核实税务申报表：按税务总表上的信息，正确填写税务申报表，并核实申报表上的信息是否正确，以及税收缴款是否符合规定。 6、核定环境保护税支付：税务机关根据审核核定结果，在税务申报表上签字，并确定支付主体及其税收缴款标准。 7、办理支付手续：支付税收的机构应将税收缴款汇款至税务机关，办理税收支付结算手续。