作废发票是指商家或纳税人将此前开具的发票作废，即使用作废标志替换已开具发票的上部分及其联次，将原发票的有效性终止。作废发票可以分为两类：一是由商家或纳税人自行作废；二是由税务机关查到存在问题而要求作废的发票。 在作废发票的过程中，商家或者纳税人有义务停止使用作废发票，并要准备发票作废证明书，将原开发票换成作废发票，将作废发票一起交给税务机关 存档。作废发票要单独存档，不能和正常发票混放。 作废发票后，商家要将作废发票交给税务局进行存档，否则将无法明确和证明作废发票的真实性，从而影响对其他情况下发票证明的准确性。 税务机关会查档核实作废发票，如有异常将采取相应的检查和处罚措施。 此外，商家要注意，作废发票所得收入不再享有税收减免。商家应及时将作废的发票交给税务机关存档，准确列明发票的原因和后果，以减少对以后财务管理的影响。 拓展知识：作废发票的有效期限是什么？作废发票的有效期限是一般两个月或者三个月，由税务机关根据每种情况来确定。但一般而言，应在被查出问题后三个月内将作废发票交给税务机关，否则将会被罚款。