不能，因为公司自建的厂房只要没有取得正式的发票，就无法记入建工程或转固定资产。其实，公司自建的厂房，应该按照税务有关规定，缴纳建筑项目增值税，以便获得正式发票，才能正确进行财务核算。拓展知识：对于公司新建的厂房，一般而言，应在税务机关开立增值税专用发票，以便符合税务管理的要求，做到公司税务统计核算的权威性，以及财务核算的准确性。