是的，公司在使用财务软件做账的时候必须要到税务局备案。一方面，这是为了将财务信息与官方相匹配，以证明财务报告的真实性；另一方面，也是为了确保税务管理工作的有效性。比如，企业在申报税收时，只有备案后，税务机关才可以查看公司的财务数据，进行审核。此外，备案还可以为公司提供税务服务，例如定期发布企业信息及税收减免的申请，以及及时提醒企业完成税务课题。总之，备案是财务软件做账的重要程序，对企业及税务机关都有重要的意义。