对于出口报关业务办理出口退税，需要在购销合同上注明的原因是：1、这种情况下，回款时扣除3.3%的手续费的可能性较大；2、3.3%的手续费直接影响回款率，而购销合同则是双方权利与义务的重要凭据；3、购销合同上一般会注明双方的交易方式，如果没有注明有关出口退税扣除3.3% 手续费的情况，将可能影响双方权利与义务的认定。因此，双方应尽量将以上信息写入购销合同，这样可以使双方的法律权益得到更好的保障。