专项资金的账务处理一般首先核实支出或收入是否符合专项资金使用范围和标准，然后根据经费来源及用途，分别入账记录，及时完成银行支付手续、收支平衡性核对等操作，最后形成相关账务报表。例如：某高校在2016年拨付专项资金100000元，用于某学科投入资金，财务根据拨付的用途，将本金账户100000元余额入账，分别记录本金、利息支出等账务操作，最后完成银行支付程序，汇总形成收支平衡性账务报表。