企业补缴税款一般要及时填写纳税申报表，确认补缴税款与原定税款之间的差额，并将差额一次性缴付补税。补缴税款后要将原定税款减去实际补缴金额，结果分两部分：1、补缴贷方税额；2、冲抵原定税额。税务部门根据纳税人补缴税款情况，单独开具补缴税款对账单及实缴税款证明，纳税人在记账时，要及时将补缴的税款，记入补缴贷方税额科目及冲抵原定税额科目，并归入期末应交税费减征额。 拓展知识：税务登记应满足税务机关要求，一般根据税种、开具发票时间（如月结、季结、期结）以及勾选相应税种的上级机关要求，开展正确的税收登记、纳税申报完成账务处理工作。