运输客票发票可分为新版发票和旧版发票。新版发票是指2012年实施的《增值税专用发票管理办法》要求全面实行的电子发票。旧版发票是指我国政府实行自2011年4月1日起的《增值税发票管理办法》所规定的原以开具的纸质发票。据不同地区的不同情况显示，在2012年1月1日前，个别地区仍未实施新版发票，需要开具旧版发票。2016年3月31日即将面临全国范围实行新版发票，在此之后旧版发票将逐步淘汰，发票开具将全面转入电子发票的制度。