首先，会计处理应该先将返还部分土地出让金的收入账户与费用账户的金额分开记录。费用账户应当记载放弃要求其土地出让金的支出，而收入账户应当记载返还部分土地出让金的收入。然后，返回部分土地出让金应该从企业收入账户中扣除，并记入费用账户，以表明这笔支出有关。最后，会计处理应当将费用账户扣除的金额凭证转入应收票据账户以便收回。如果企业有特殊税收优惠，可以根据相关税收条例记入税金支出账户，从而与应税劳动收入的税收减免相一致。