员工重复报销的处理原则是：一旦发现重复报销，就需要会计处理，即使两次报销间隔很大也不例外。会计将会对重复报销进行审查，进而做出决定，要求其退还款项或者决定客观存在的经济合理性、实质性等原则，另外还需收集和查看相关文件，形成具体的处理意见，最后等待上级、法律机构的发文。 拓展知识：会计处理重复报销时，还需根据法规和政策的要求，把查明的经济责任纳入企业的应收账款范围，实现经济效益的双赢。