企业应纳税款计算：40万汽车修理收入应纳税款为：40万*3%=1.2万元；20万汽车配件收入应纳税款为：20万*3%=0.6万元；本月取得增值税专用发票3万元，应扣减进项税额3万元，总共应纳税款为：1.2万+0.6万-3万=0元。 拓展知识：一般纳税人是指一定条件下，根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，个体工商户等涉税行为被认定为纳税人的单位。一般纳税人，可以享受企业所得税专用抵扣权，可以把购货的增值税专用发票上的进项税额减免掉税前扣除项目中进行抵扣。