首先，电商店铺当月服务费先从店铺账户提前扣除，之后才开发票的做账流程如下： 1、登记店铺的商品销售明细账，核对实际销售额是否与日记账中记载的商品销售金额相符，如果有出入，应当及时进行调整，以保证账务的准确性。 2、根据电商店铺所提供的购销单，准确登记应付帐款抵扣明细账，记录有关付款情况，如有付款发票，也要正确登记。 3、根据电商店铺的服务费用记账单，正确登记应付服务费用抵扣明细账，记录有关付款情况，如有付款发票，也要正确登记。 4、账务人员根据当月应付服务费用，从店铺账户中提前扣除当月服务费，然后开具现金支付款发票，并根据开票情况进行台帐登记。 5、按照月结收支原则，把店铺账户的收入、支出、余额进行累加计算，形成账户月末期末余额，确认其合法性，同时进行账务内部控制，以确保公司账务户口的完整性。