专利代理费的入账首先要完成相关的发票、收据的开具，然后在财务的账本中予以记账，把专利代理费归类于代理费用。专利代理费的入账流程为：1、发票登记：首先，将客户收到的开具专利代理费发票进行登记，审核发票是否正确，并且确定总金额是否真实可靠；2、银行入账：其次，将客户收到的开具专利代理费发票登记完毕后，经过审核等环节，代理费将转入公司的账户，即银行入账； 3、期末报表：最后，公司将专利代理费等费用进行汇总分析，并予以记账，以便在会计期末的报表中体现，以便统计与分析专利代理费的支出和成本情况。