企业准备注销时，有两万的进项发票没有认证抵扣，可以通过多重方式来处理这笔货款，保障企业的权益。其一是将收款账户维持，然后继续上缴发票，继续申请抵扣税款；其二是可以向税务机关申请退回税款，但是届时需要准备好相关文件；其三是可以销售商品或服务，然后发出正常发票，同样能申请抵扣税款。以上几种方式，企业可以根据实际情况采用一种更适合自己的方式，以保证及时还原税款。 拓展知识：如果企业的税款抵扣已经超出实际支出，可以就应纳税所征税的项目向税务部门提出减免申请，由税务机关处理出相应减免或退回税款。 应用案例：某家企业于2018年进行注销，企业曾申请进项抵扣税款，但由于系统原因未认证成功，最终导致出现两万元未抵扣成功的情况。该企业向税务机关提出减免申请，凭借购置货物及支付劳务服务的有效发票，最终获得未抵扣税款的减免。