首先，根据国家财政部的相关规定，在商贸企业之间的运输中的损失，应分别记入关联企业的经营成本和销售费用。具体来说，企业应将快递损失记入销售费用，并将陪赔偿客户的费用记入经营成本。除此之外，快递赔偿金额也应以抵减企业的经营成本为基础。 拓展知识：商贸企业之间的交易，运输过程中关系损失，尤其是损失会让双方很难达成一致，所以企业在经营中一定要注意运输保护，加强全程监控，在物流过程中能及时发现问题，并及时处理，从而能够减少损失，为自己做好风险防范。